11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1855 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1855  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.076354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1132  hypothetical protein  49.16 
 
 
238 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0602  ABC transporter protein  47.26 
 
 
238 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4275  hypothetical protein  51.26 
 
 
238 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.273706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0451  hypothetical protein  44.17 
 
 
239 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4448  putative integral membrane protein  42.19 
 
 
239 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.440749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4167  hypothetical protein  41.71 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3787  hypothetical protein  42.25 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0978  hypothetical protein  33.72 
 
 
264 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377564  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06890  hypothetical protein  32.83 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390975  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3974  hypothetical protein  30.85 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0800365  normal  0.28897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>