11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_R0005 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_R0005  tRNA-Sec  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0051  tRNA-Sec  90.22 
 
 		 92 bp  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0506501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0052  tRNA-Sec  92.54 
 
 		 92 bp  93.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  87.5 
 
 		 2076 bp  87.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0001  tRNA-Sec  87.32 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63460  tRNA-Sec  87.93 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5525  tRNA-Sec  87.93 
 
 		 96 bp  60  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0005  tRNA-Sec  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4296  tRNA-Sec  84.51 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4154  tRNA-Sec  84.51 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577336  normal  0.0295304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0001  tRNA-Sec  84.51 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>