19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4969 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4969  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553476  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4652  hypothetical protein  88.33 
 
 
60 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659155  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9156  Helicase subunit of the DNA excision repair complex  66.67 
 
 
115 aa  87.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  66.67 
 
 
58 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  65 
 
 
58 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4310  hypothetical protein  54.84 
 
 
62 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0646462  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8076  hypothetical protein  61.11 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  59.18 
 
 
52 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  49.02 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  53.06 
 
 
54 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5552  hypothetical protein  43.64 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.423548  normal  0.0424308 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4969  hypothetical protein  39.62 
 
 
54 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.689573 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  40 
 
 
56 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  46.81 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  42.86 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  45.83 
 
 
57 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  42.55 
 
 
55 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  42.55 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  44.68 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>