41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1668 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  426  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  34.85 
 
 
205 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  36.55 
 
 
218 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  36.41 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  35.5 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  36.18 
 
 
208 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  35.35 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  34.34 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  35.57 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  34.34 
 
 
205 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  34.34 
 
 
205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  34.62 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  34.54 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  33.98 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  34.54 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  34.54 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  34.54 
 
 
208 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  34.54 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  34.02 
 
 
208 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  34.47 
 
 
207 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  34.02 
 
 
208 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  33.99 
 
 
212 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  31.63 
 
 
205 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  33.85 
 
 
443 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  32.49 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  31.66 
 
 
228 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  31.4 
 
 
228 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  29.08 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  28.23 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  29.35 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  28.85 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93854  predicted protein  26.88 
 
 
340 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00630097  normal  0.0600499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>