23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0495 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0495  hypothetical protein  100 
 
 
46 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2584  hypothetical protein  72.22 
 
 
51 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3208  hypothetical protein  75 
 
 
51 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0017  hypothetical protein  62.22 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2649  hypothetical protein  62.22 
 
 
50 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3015  hypothetical protein  60.47 
 
 
50 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1121  hypothetical protein  67.5 
 
 
48 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6798  hypothetical protein  65.79 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585232  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2809  hypothetical protein  53.49 
 
 
47 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452798  normal  0.575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1132  hypothetical protein  67.5 
 
 
48 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1704  hypothetical protein  69.44 
 
 
48 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252579  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2091  hypothetical protein  72.22 
 
 
51 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1977  hypothetical protein  60.53 
 
 
50 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1439  hypothetical protein  60.53 
 
 
51 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2850  hypothetical protein  58.14 
 
 
47 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1741  hypothetical protein  60.53 
 
 
50 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869868  normal  0.0905796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1643  hypothetical protein  63.89 
 
 
48 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1223  hypothetical protein  60.47 
 
 
51 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.675037  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1098  hypothetical protein  58.14 
 
 
51 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0448109  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1242  hypothetical protein  60.47 
 
 
51 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0337  hypothetical protein  52.63 
 
 
45 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207605  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2808  hypothetical protein  61.11 
 
 
51 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4344  hypothetical protein  75 
 
 
51 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.120907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>