19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5000 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_5000  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  151  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  55.22 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  55.88 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0674  hypothetical protein  47.06 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  52.46 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0513  hypothetical protein  44.26 
 
 
68 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  42.19 
 
 
78 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  40.28 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0896  hypothetical protein  35.82 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89715  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  37.31 
 
 
90 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  32.35 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  30 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  34.78 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  32.39 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  32.79 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  38.57 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  32.26 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  29.69 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>