39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4948 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4948  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  100 
 
 		 162 aa  303  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.523973  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  64.1 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0476  hypothetical protein  30.25 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000160273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0348  hypothetical protein  30.95 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3306  hypothetical protein  30.36 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3289  protein of unknown function DUF1097  30.36 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0335  hypothetical protein  30.36 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0377  hypothetical protein  29.76 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.656327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00276  hypothetical protein  29.94 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00273  predicted inner membrane protein  29.94 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.764997  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5091  hypothetical protein  28.49 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135209  normal  0.26552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1234  inner membrane protein YcdZ  29.81 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698042  normal  0.958349 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05920  hypothetical protein  26.62 
 
 		 206 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1249  hypothetical protein  28.14 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.540058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1204  inner membrane protein YcdZ  28.14 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.541907  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2052  inner membrane protein YcdZ  28.14 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01033  predicted inner membrane protein  30.12 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4709  hypothetical protein  26.81 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365638  normal  0.665759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1154  hypothetical protein  30.12 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.308865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01040  hypothetical protein  30.12 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0650  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125133  normal  0.514619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1415  hypothetical protein  30.12 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0524852 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2563  hypothetical protein  30.12 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.232461 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6979  hypothetical protein  29.23 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2097  hypothetical protein  30.12 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2293  hypothetical protein  30.59 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2609  protein of unknown function DUF1097  30.12 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00104485  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2235  inner membrane protein YcdZ  27.54 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1496  hypothetical protein  24.5 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00154693  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0051  inner membrane protein  28.07 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000191  hypothetical protein  27.81 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0212289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1155  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1285  hypothetical protein  24.5 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0686848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3290  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3458  putative transmembrane protein  28.46 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1143  hypothetical protein  33.13 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1552  hypothetical protein  28.9 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215305  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5827  hypothetical protein  28.82 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>