24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4799 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4799  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49808  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  68 
 
 		 183 aa  237  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  180  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  41.99 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  39.67 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  40.22 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  38.73 
 
 		 193 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  37.22 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  37.08 
 
 		 193 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  40.78 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  33.9 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  35.09 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4528  cupin 2 domain-containing protein  34.64 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.42906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  32.75 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  35.2 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  31.21 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  25.15 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.355646 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  31.82 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  28.57 
 
 		 793 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04830  hypothetical protein  26.34 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3009  hypothetical protein  34.55 
 
 		 241 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  36.73 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>