42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3423 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3423  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  156  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17114  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5106  hypothetical protein  80.6 
 
 
69 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0374324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7216  hypothetical protein  49.12 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393759  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01748  hypothetical protein  49.09 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.875882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4049  hypothetical protein  43.42 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18404  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3816  hypothetical protein  58.33 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140719  normal  0.253569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3230  hypothetical protein  44.16 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0429  hypothetical protein  45.61 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0431187  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3215  hypothetical protein  44.16 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.552244  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4219  hypothetical protein  47.76 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3176  hypothetical protein  42.86 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1431  hypothetical protein  56.82 
 
 
61 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403296  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0290  hypothetical protein  47.37 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1322  hypothetical protein  47.37 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2625  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3911  hypothetical protein  45 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0787  hypothetical protein  45 
 
 
76 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1923  hypothetical protein  41.89 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2686  hypothetical protein  41.89 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2058  hypothetical protein  41.89 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0854  hypothetical protein  41.89 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0818  hypothetical protein  45 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0335  hypothetical protein  45 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0777  hypothetical protein  41.38 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4662  hypothetical protein  52.08 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786258  normal  0.0875465 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4530  hypothetical protein  52.08 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7011  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4301  hypothetical protein  52.17 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0716  hypothetical protein  43.33 
 
 
76 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3719  hypothetical protein  48 
 
 
73 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0699  hypothetical protein  43.33 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0340  hypothetical protein  45.45 
 
 
69 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0904  hypothetical protein  48.08 
 
 
74 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1305  hypothetical protein  44 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567978  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4536  hypothetical protein  43.33 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000488103  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0923  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0564  hypothetical protein  50 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.797125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2565  hypothetical protein  41.67 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5155  hypothetical protein  47.27 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.235295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0889  hypothetical protein  40.62 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0851  hypothetical protein  35.14 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00441128  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1016  hypothetical protein  40.91 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.698133  normal  0.349363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1195  hypothetical protein  43.64 
 
 
76 aa  40.8  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>