62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1072 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  100 
 
 
167 aa  322  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  68.71 
 
 
169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  68.71 
 
 
169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  63.27 
 
 
168 aa  191  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  66.67 
 
 
168 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  54.73 
 
 
171 aa  158  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  54.42 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  52.05 
 
 
168 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  44.85 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  44.22 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  43.54 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  42.86 
 
 
174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  42.86 
 
 
174 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  46 
 
 
175 aa  120  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  50.34 
 
 
173 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  37.33 
 
 
172 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  49.66 
 
 
169 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  38.41 
 
 
183 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  38.36 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  40.37 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  32.34 
 
 
175 aa  91.7  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  33.33 
 
 
179 aa  90.5  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  35.58 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  39.58 
 
 
190 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  34.97 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  34.97 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  34.97 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  34.97 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  34.97 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  31.25 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  34.97 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  35.81 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  31.41 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  32.5 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  32.5 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  31.13 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  32.65 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  29.41 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  29.41 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  30.54 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  33.99 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  30.13 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  31.37 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  31.68 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  31.68 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  26.7 
 
 
220 aa  54.3  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  31.71 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  26.14 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  28.29 
 
 
194 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  26.62 
 
 
207 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  26.32 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  26.71 
 
 
201 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  26.09 
 
 
201 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  25.47 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  27.21 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  27.52 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  25.47 
 
 
203 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  26.63 
 
 
210 aa  45.1  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  26.98 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  32.58 
 
 
164 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  28.03 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  30.92 
 
 
191 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>