20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4610 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  187  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  63.33 
 
 		 90 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  60 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  58.89 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  62.22 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  60 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2189  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  123  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  60 
 
 		 90 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  58.89 
 
 		 90 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  58.89 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  55.56 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  49.44 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  44.94 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  45.56 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  42.22 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2065  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7096  hypothetical protein  28.41 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1074  hypothetical protein  32.53 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  22.47 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3192  hypothetical protein  27.78 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>