32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3075 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3143  dihydropteroate synthase DHPS  73.65 
 
 		 471 aa  705    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3075  dihydropteroate synthase DHPS  100 
 
 		 495 aa  1005    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5941  dihydropteroate synthase DHPS  65.96 
 
 		 461 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2616  pterin-binding domain-containing protein  75 
 
 		 479 aa  729    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.521784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6492  dihydropteroate synthase DHPS  65.12 
 
 		 462 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.137356 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2441  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein  64.89 
 
 		 460 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1245  pterin-binding domain-containing protein  56.69 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1581  dihydropteroate synthase, DHPS  56.94 
 
 		 481 aa  498  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00143208  unclonable  0.000000236622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1793  dihydropteroate synthase DHPS  50.1 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.425163  normal  0.963011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2177  dihydropteroate synthase DHPS  49.69 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339932  normal  0.330618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1842  dihydropteroate synthase DHPS  49.69 
 
 		 524 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5321  dihydropteroate synthase DHPS  51.07 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5017  dihydropteroate synthase DHPS  52.78 
 
 		 471 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2725  dihydropteroate synthase DHPS  49.79 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63462  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2394  dihydropteroate synthase DHPS  49.04 
 
 		 464 aa  428  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4100  dihydropteroate synthase DHPS  48.23 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2035  dihydropteroate synthase DHPS  34.8 
 
 		 489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0717  dihydropteroate synthase-related protein  28.34 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0306  dihydropteroate synthase  27.95 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0190  hypothetical protein  26.09 
 
 		 493 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0222  dihydropteroate synthase-related protein  26.16 
 
 		 498 aa  126  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1090  dihydropteroate synthase-related protein  22.33 
 
 		 523 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0516227  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1829  dihydropteroate synthase-related protein  25.47 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0605  dihydropteroate synthase-related protein  22.47 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0827  dihydropteroate synthase-related protein  21.76 
 
 		 523 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0892  dihydropteroate synthase-related protein  23.38 
 
 		 523 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1673  hypothetical protein  27.05 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.293824  hitchhiker  0.0000000161519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0631  dihydropteroate synthase-related protein  27.21 
 
 		 512 aa  94.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2712  dihydropteroate synthase DHPS  26.33 
 
 		 471 aa  95.1  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0215  dihydropteroate synthase-related protein  27.31 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2299  dihydropteroate synthase-related protein  25.64 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2402  dihydropteroate synthase  26.18 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>