11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2465 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  340  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3858  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116475 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1036  gp74  35.65 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.28411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1900  hypothetical protein  47.62 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000897729  hitchhiker  0.00160022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0299  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2234  hypothetical protein  44.26 
 
 		 97 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0820  hypothetical protein  40.26 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.158787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3891  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000262818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1553  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000304739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00499  predicted protein  41.94 
 
 		 96 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.359553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00504  hypothetical protein  41.94 
 
 		 96 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.305111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>