13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2298 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2298  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2007  hypothetical protein  55.91 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000443112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2753  hypothetical protein  53.85 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2112  hypothetical protein  49.74 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.870812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6206  hypothetical protein  53.8 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219288  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2983  hypothetical protein  48.62 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.206465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2283  hypothetical protein  48.63 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0662  hypothetical protein  48.07 
 
 		 175 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3137  hypothetical protein  48.04 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6159  hypothetical protein  44.86 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6367  hypothetical protein  47.83 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0052  hypothetical protein  42.08 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.79454  normal  0.653619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1570  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>