59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1671 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1671  membrane protein  100 
 
 		 112 aa  233  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1560  putative transmembrane protein  68.63 
 
 		 105 aa  158  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1663  putative transmembrane protein  69.61 
 
 		 105 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1993  putative transmembrane protein  67.65 
 
 		 105 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.072435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1132  hypothetical protein  69.7 
 
 		 105 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1251  putative transmembrane protein  64.71 
 
 		 105 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4965  membrane protein  73.83 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0713877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1910  hypothetical protein  59.22 
 
 		 105 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1435  membrane protein  61.62 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2772  hypothetical protein  62.24 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4602  membrane protein  60.61 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1355  hypothetical protein  62.24 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.246165 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1457  membrane protein  60.61 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446006  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0975  membrane protein  60.61 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1792  membrane protein  58.59 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1378  membrane protein  59.6 
 
 		 105 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.792947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3798  hypothetical protein  60.2 
 
 		 103 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22630  hypothetical protein  59.62 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000561464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4015  hypothetical protein  60.2 
 
 		 103 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000344085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1574  hypothetical protein  53.33 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1402  hypothetical protein  60.2 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.021446  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4509  hypothetical protein  60.2 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1615  hypothetical protein  60.61 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0405  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0757  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1708  membrane protein  57.58 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1686  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1476  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0943  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1863  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1477  membrane protein-like  55.86 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111378  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2617  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3594  hypothetical protein  61.62 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.617251  normal  0.663299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1800  hypothetical protein  60.61 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0271  hypothetical protein  52.48 
 
 		 101 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00945807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3076  hypothetical protein  60.42 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2498  hypothetical protein  52.48 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1824  membrane protein-like protein  55.77 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0866177  normal  0.631678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00580  predicted membrane protein  53.51 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2721  hypothetical protein  57.29 
 
 		 101 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2828  hypothetical protein  60.42 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2895  hypothetical protein  61.11 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2654  hypothetical protein  59.38 
 
 		 101 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1256  hypothetical protein  53.26 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.341048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3293  hypothetical protein  48.08 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0172  hypothetical protein  56.04 
 
 		 134 aa  106  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2916  hypothetical protein  53.61 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.234722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1468  hypothetical protein  51.55 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.722008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1432  hypothetical protein  51.55 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1438  hypothetical protein  51.02 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0835  hypothetical protein  53.61 
 
 		 109 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310585  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2647  hypothetical protein  53.33 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5233  hypothetical protein  47.42 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1127  hypothetical protein  52.58 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.958574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2375  hypothetical protein  46.24 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276306  normal  0.0198627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1338  membrane protein  60.94 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1220  hypothetical protein  39.22 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3518  hypothetical protein  40.86 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0998  hypothetical protein  45.56 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.173799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>