55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0947 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0947  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0855  hypothetical protein  75 
 
 		 200 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.942711  normal  0.0675477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2951  hypothetical protein  73.2 
 
 		 203 aa  289  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3641  hypothetical protein  73.2 
 
 		 203 aa  289  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3394  hypothetical protein  73.68 
 
 		 198 aa  289  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.843919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1097  hypothetical protein  70.47 
 
 		 201 aa  284  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0275723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1487  hypothetical protein  70.1 
 
 		 198 aa  283  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3355  hypothetical protein  71.65 
 
 		 198 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1492  hypothetical protein  71.04 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3983  hypothetical protein  57.65 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000946307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3203  hypothetical protein  57.07 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.95995  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0534  hypothetical protein  47.96 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0510  hypothetical protein  47.96 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2498  hypothetical protein  45.86 
 
 		 218 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3286  hypothetical protein  45.86 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3500  hypothetical protein  45.86 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.591854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1278  hypothetical protein  45.86 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0419  hypothetical protein  45.86 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3462  hypothetical protein  45.86 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3497  hypothetical protein  45.86 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2617  hypothetical protein  43.54 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0577  hypothetical protein  47.16 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0609  hypothetical protein  47.16 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0126  hypothetical protein  47.16 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3027  hypothetical protein  42.86 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2862  hypothetical protein  44.23 
 
 		 229 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3691  hypothetical protein  46.59 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0535  hypothetical protein  43.48 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2776  hypothetical protein  46.59 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.584619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3423  hypothetical protein  43.17 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172088  normal  0.0352219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3061  hypothetical protein  43.33 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2783  hypothetical protein  42.35 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1166  hypothetical protein  44.75 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2626  hypothetical protein  42.08 
 
 		 217 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3444  hypothetical protein  37.02 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0200  hypothetical protein  39.49 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2463  hypothetical protein  31.34 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2786  hypothetical protein  37.44 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00487472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1661  hypothetical protein  34.38 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1008  hypothetical protein  34.87 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0245  hypothetical protein  35.88 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1726  hypothetical protein  32.07 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2252  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0323  hypothetical protein  39.68 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3941  hypothetical protein  41.59 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000387144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1867  hypothetical protein  30.61 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2212  hypothetical protein  30.61 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.625381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1191  hypothetical protein  36.57 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2753  hypothetical protein  28.64 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02357  hypothetical protein  33.06 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3070  hypothetical protein  35 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3242  hypothetical protein  32.28 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3021  hypothetical protein  32.61 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.214048  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1935  hypothetical protein  29.21 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0273  hypothetical protein  25.29 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.172532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>