93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0423 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  100 
 
 		 173 aa  340  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  51.01 
 
 		 171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  50.34 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  48.99 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  48.99 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  47.59 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  45.64 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  45.52 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  44.83 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  44.83 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  46.21 
 
 		 169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  50 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  42.86 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  47.26 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  50.34 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  41.13 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  42.86 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  36.49 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  39.33 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  35.26 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  36.02 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  36.02 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  33.94 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  38.89 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  33.77 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  33.77 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  33.77 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  34.81 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  31.94 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  35.48 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  34.93 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  33.97 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  32.21 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  31.58 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  29.63 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  31.54 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  30.72 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  29.93 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  29.93 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  30 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  32.67 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  32.7 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  32.67 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  32.52 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.29 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  29.49 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  32.67 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.2 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  28.71 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  26.67 
 
 		 194 aa  48.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  29.14 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  24.68 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  27.15 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  25.33 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  27.48 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  26.35 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  24.86 
 
 		 202 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  24.86 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.59 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  26.32 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.59 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  26.67 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  28.38 
 
 		 191 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  27.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  27.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  27.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>