112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1440 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0285    100 
 
 
1349 bp  2010    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0743    100 
 
 
2312 bp  1992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0971    99.9 
 
 
2219 bp  1996    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1409    99.9 
 
 
2567 bp  1986    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1440    100 
 
 
1355 bp  2686    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.368011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2468    99.9 
 
 
2102 bp  1984    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2720    99.9 
 
 
2729 bp  1984    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0157    100 
 
 
2801 bp  1992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0699  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.504013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0015  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.461539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0069  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0114  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0929  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.473134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0143  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1006  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0215  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0750  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0235  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.800735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0280  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0316  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0165455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0436  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0515  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0782  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0810  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0896  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0904  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0999  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1062  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1091  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1206  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1240  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1257  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1279  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1292  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.035818  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0993  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1362  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1416  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1575  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1655  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0420021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1663  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0780346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1671  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0737261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1746  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1779  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.076301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1810  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1834  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1929  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.721317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1944  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2010  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2043  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2087  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2115  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2162  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2179  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2249  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327358  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1017  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0767  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2405  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2485  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2488  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2599  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0832  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0974  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2685  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2708  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2731  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2752  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2760  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2808  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2881  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2934  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2942  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2959  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3006  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3054  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0024  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0032  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0043  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0047  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0070  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0081  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0096  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0131  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0174  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0190  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0220  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0228  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0235  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0242  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0258  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.663843  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0271  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.187318  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0334  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0250608  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0471  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0516  transposase  100 
 
 
348 bp  500  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0290  transposase  99.6 
 
 
348 bp  492  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0765    99.6 
 
 
348 bp  492  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1049    99.6 
 
 
348 bp  492  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1715  transposase  99.6 
 
 
348 bp  492  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2261  transposase  99.6 
 
 
348 bp  492  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2461  transposase  99.6 
 
 
348 bp  492  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2952  transposase  99.6 
 
 
348 bp  492  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>