35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1049 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  100 
 
 
541 aa  1118    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  46.29 
 
 
543 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  38.32 
 
 
567 aa  349  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  38.32 
 
 
567 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  38.12 
 
 
567 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  39.64 
 
 
565 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  36.64 
 
 
551 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  38.58 
 
 
323 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  37.37 
 
 
359 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  37.37 
 
 
359 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  37.83 
 
 
323 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5075  hypothetical protein  39.47 
 
 
230 aa  170  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0681  hypothetical protein  38.26 
 
 
232 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0742  hypothetical protein  33.18 
 
 
229 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.10229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0565  hypothetical protein  37.83 
 
 
230 aa  160  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.465028 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05048  hypothetical protein  32.74 
 
 
229 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  32.37 
 
 
360 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1304  hypothetical protein  31.51 
 
 
230 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1447  hypothetical protein  35.24 
 
 
228 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129718  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  36.75 
 
 
364 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2744  hypothetical protein  35.24 
 
 
228 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.950913  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  35.68 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0721  hypothetical protein  34.96 
 
 
225 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0262  hypothetical protein  33.65 
 
 
233 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  43.12 
 
 
231 aa  123  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  45.83 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  34.92 
 
 
232 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  29.03 
 
 
197 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  23.23 
 
 
250 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  48.98 
 
 
58 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  24.62 
 
 
692 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  23.92 
 
 
692 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  26.81 
 
 
240 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  55.26 
 
 
194 aa  44.3  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>