25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05049 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  476  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  62.28 
 
 
231 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  44.31 
 
 
364 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  38.39 
 
 
565 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  36.67 
 
 
567 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  36.67 
 
 
567 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  36.53 
 
 
551 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  36.67 
 
 
567 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  59.8 
 
 
178 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  37.37 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  36.84 
 
 
323 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  40.24 
 
 
359 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  40.24 
 
 
359 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  34.38 
 
 
321 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  36.2 
 
 
360 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  34.92 
 
 
541 aa  108  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  36.36 
 
 
543 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  40.65 
 
 
125 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  72.73 
 
 
58 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  25.99 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  39.44 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  25.13 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  30.87 
 
 
741 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  30.87 
 
 
741 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  26.34 
 
 
241 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>