11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02160 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02160  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1643  rhodopsin  42.54 
 
 		 250 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2966  rhodopsin  31.47 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0448  rhodopsin  33.88 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.937786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6515  rhodopsin  26.4 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3652  rhodopsin  25.75 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.212812  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2680  rhodopsin  29.72 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1795  rhodopsin  23.86 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0085  rhodopsin  28.24 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0537  rhodopsin  24.77 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326912  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3441  rhodopsin  23.24 
 
 		 233 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000429167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>