23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01792 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01792  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003884  DNA repair ATPase  90.95 
 
 
232 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1499  hypothetical protein  72.83 
 
 
262 aa  371  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000480676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1690  hypothetical protein  59.84 
 
 
254 aa  321  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.278449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1622  hypothetical protein  33.47 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1804  hypothetical protein  31.03 
 
 
257 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389393  hitchhiker  0.0035838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1856  hypothetical protein  30.65 
 
 
259 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0849639  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2608  hypothetical protein  30.65 
 
 
259 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0307419  decreased coverage  0.000510715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2495  hypothetical protein  30.65 
 
 
259 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2488  hypothetical protein  30.65 
 
 
259 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01943  hypothetical protein  34.73 
 
 
250 aa  121  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1536  hypothetical protein  30.2 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0198685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2840  hypothetical protein  30.36 
 
 
257 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0776012  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1323  hypothetical protein  31.33 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2249  hypothetical protein  30.65 
 
 
259 aa  118  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1730  hypothetical protein  31.05 
 
 
259 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0608955  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1661  hypothetical protein  31.05 
 
 
259 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100464  unclonable  0.0000162352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1586  hypothetical protein  31.05 
 
 
259 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.0602505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2650  hypothetical protein  31.45 
 
 
259 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1623  hypothetical protein  30.36 
 
 
258 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.0571919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1449  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000835814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1199  hypothetical protein  31.51 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2097  hypothetical protein  29.75 
 
 
259 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>