65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003593 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003593  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  331  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1243  hypothetical protein  56.67 
 
 
159 aa  185  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0924995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05610  hypothetical protein  48.59 
 
 
155 aa  157  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237845  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1747  hypothetical protein  50.35 
 
 
163 aa  152  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2358  protein of unknown function DUF336  49.66 
 
 
172 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.61424  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1996  hypothetical protein  48.25 
 
 
161 aa  143  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0452  hypothetical protein  47.55 
 
 
172 aa  130  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1734  hypothetical protein  45.45 
 
 
165 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216168  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1814  hypothetical protein  46.31 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0773  hypothetical protein  46.26 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29320  hypothetical protein  45.21 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1246  hypothetical protein  46.26 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1831  hypothetical protein  46.26 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1983  hypothetical protein  46.26 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0389  hypothetical protein  46.26 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1731  hypothetical protein  46.26 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2503  hypothetical protein  44.06 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2506  hypothetical protein  44.9 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1660  hypothetical protein  44.76 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0922603  normal  0.0534906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5390  hypothetical protein  41.29 
 
 
168 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2872  hypothetical protein  40.82 
 
 
164 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2653  hypothetical protein  42.86 
 
 
165 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2914  hypothetical protein  42.86 
 
 
165 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963659  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1534  hypothetical protein  40.56 
 
 
165 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1558  hypothetical protein  40.56 
 
 
165 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1078  hypothetical protein  40.56 
 
 
165 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1459  hypothetical protein  40.56 
 
 
165 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1674  hypothetical protein  42.66 
 
 
165 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1792  hypothetical protein  44.12 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4700  hypothetical protein  40.56 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1480  hypothetical protein  40.56 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1581  hypothetical protein  43.94 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3104  hypothetical protein  38.3 
 
 
216 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3426  hypothetical protein  38.73 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1764  hypothetical protein  43.54 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1914  protein of unknown function DUF336  37.75 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.180095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2342  hypothetical protein  44.2 
 
 
161 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3401  hypothetical protein  36.62 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3413  hypothetical protein  36.62 
 
 
206 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3449  hypothetical protein  35.21 
 
 
158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3196  hypothetical protein  35.21 
 
 
216 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3175  hypothetical protein  35.92 
 
 
158 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000510798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3413  hypothetical protein  35.92 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4062  hypothetical protein  42.66 
 
 
155 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.628231  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2291  protein of unknown function DUF336  38.81 
 
 
156 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4513  hypothetical protein  37.93 
 
 
164 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1842  hypothetical protein  36.69 
 
 
158 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.935839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3106  hypothetical protein  35.97 
 
 
158 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0245  protein of unknown function DUF336  36.81 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1766  hypothetical protein  35.77 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.267084  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0133  protein of unknown function DUF336  44.85 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1411  hypothetical protein  39.42 
 
 
169 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.851451  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1367  hypothetical protein  38.69 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66044  predicted protein  33.55 
 
 
162 aa  87  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.148486  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1852  hypothetical protein  34.97 
 
 
182 aa  84.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1419  hypothetical protein  32.58 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0937  hypothetical protein  32.58 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1397  hypothetical protein  32.58 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12350  hypothetical protein  33.56 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4563  hypothetical protein  31.06 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172322  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1338  hypothetical protein  32.35 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1299  hypothetical protein  32.14 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2865  protein of unknown function DUF336  31.43 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0168022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1896  hypothetical protein  28.15 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02061  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04590)  31.84 
 
 
439 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>