17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001939 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001939  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3711  hypothetical protein  43.08 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0265  hypothetical protein  56.36 
 
 		 55 aa  52.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3999  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2847  hypothetical protein  44.62 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2740  hypothetical protein  44.62 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2672  hypothetical protein  44.62 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4136  hypothetical protein  41.54 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0316  hypothetical protein  44.9 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01266  hypothetical protein  47.5 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.204518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  40.48 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2086  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1420  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1412  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1446  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2934  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3025  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>