16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0672 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0672  protein gp27  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0765  protein gp27  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2677  hypothetical protein  77.72 
 
 		 193 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2087  hypothetical protein  47.06 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0674169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2134  hypothetical protein  46.81 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0665  hypothetical protein  45.99 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0669  Mu-like prophage FluMu protein GP27  29.84 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3387  Mu-like prophage FluMu protein GP27  28.79 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2702  hypothetical protein  27.18 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.22596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3781  phage-like protein  27.66 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1295  hypothetical protein  24.86 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2105  hypothetical protein  24.86 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3009  methyl-accepting chemotaxis protein  26.28 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3049  hypothetical protein  28.14 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1643  putative bacteriophage protein  23.98 
 
 		 183 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2251  hypothetical protein  23.53 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>