25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0995 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0995  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  221  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000808008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  31.18 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  30.85 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  31.68 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  28.71 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  36.26 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  36.26 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  30.11 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4020  hypothetical protein  31.18 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79512  normal  0.606869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  29.03 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0800  hypothetical protein  27.96 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.662726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3764  hypothetical protein  26.88 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.211886 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  33.75 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1408  hypothetical protein  27.37 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4059  hypothetical protein  26.88 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  32.22 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  29.79 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  28.72 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3528  hypothetical protein  28.92 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  32.18 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  25.81 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  26.88 
 
 		 94 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  26.88 
 
 		 94 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  21.88 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>