46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0843 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 
149 aa  300  6.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  99.33 
 
 
149 aa  296  5e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  47.1 
 
 
142 aa  142  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  141  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  50.74 
 
 
146 aa  133  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  42.22 
 
 
159 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  38.24 
 
 
152 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  34.44 
 
 
159 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  31.03 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  34.27 
 
 
165 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  38.78 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  33.77 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  35.71 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  32.41 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  38.33 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  29.73 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  34.71 
 
 
173 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  28.77 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  33.61 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  30.77 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  30.6 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  27.08 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  29.85 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  29.29 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  30.33 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  32.59 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  32.06 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  28.46 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  29.45 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  29.63 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  30.14 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  34.15 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  31.82 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  24.59 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  32.06 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  26.23 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  29.69 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  30.68 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  23.48 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  22.3 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  25.2 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  28.18 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1960  flagellar assembly protein FliW  27.35 
 
 
127 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3002  protein of unknown function DUF180  29.06 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  27.64 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>