19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1116 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1116  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  257  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1298  protein of unknown function DUF498  43.75 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1789  protein of unknown function DUF498  42.48 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2089  hypothetical protein  30.95 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0432  hypothetical protein  34.17 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0667621  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1091  hypothetical protein  30.91 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0893854  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0924  hypothetical membrane spanning protein  30 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2388  hypothetical protein  28.07 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1437  hypothetical protein  32.46 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0515  hypothetical protein  27.83 
 
 
120 aa  47  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.25915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3038  hypothetical protein  31.03 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1046  hypothetical protein  27.83 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.737  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0902  hypothetical protein  27.83 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0516  hypothetical protein  26.72 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0841  hypothetical protein  32.17 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.479517  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0182  hypothetical protein  30.11 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0107793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0631  protein of unknown function DUF498  26.61 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0471  hypothetical protein  26.61 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2657  hypothetical protein  29.82 
 
 
128 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>