39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0667 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 
379 aa  770    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  57.14 
 
 
369 aa  429  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  57.92 
 
 
367 aa  426  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  56.47 
 
 
367 aa  419  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  57.42 
 
 
367 aa  419  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  56.28 
 
 
367 aa  418  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  55.96 
 
 
386 aa  393  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.8 
 
 
389 aa  372  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  40.6 
 
 
367 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  40.49 
 
 
367 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  40.49 
 
 
367 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  40.6 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  34.34 
 
 
430 aa  239  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  35.97 
 
 
363 aa  229  6e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  37.5 
 
 
365 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  36.67 
 
 
365 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  37.22 
 
 
365 aa  222  8e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  35.87 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  32.54 
 
 
339 aa  217  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  34.44 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.99 
 
 
364 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  34.5 
 
 
357 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  32.4 
 
 
362 aa  196  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  31.45 
 
 
370 aa  193  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.51 
 
 
366 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  32.97 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  33.43 
 
 
369 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  31.89 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  32.4 
 
 
362 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  29.3 
 
 
361 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  31.59 
 
 
362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  32.88 
 
 
362 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  29.51 
 
 
362 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  32.47 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  26.77 
 
 
432 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27014  predicted protein  28.22 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0279403  normal  0.0136943 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  33.55 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  27.76 
 
 
559 aa  76.6  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31531  predicted protein  25.91 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288827  normal  0.0593553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>