11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0428 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0428  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  653    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0021  hypothetical protein  44.19 
 
 
305 aa  219  6e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0934  hypothetical protein  45.12 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00193812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1546  hypothetical protein  43.43 
 
 
301 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1056  hypothetical protein  42.52 
 
 
306 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.730009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0751  hypothetical protein  38.98 
 
 
310 aa  207  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1358  hypothetical protein  36.95 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000906446  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0584  hypothetical protein  37.66 
 
 
309 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.43357 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0982  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 
308 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0208457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0376  hypothetical protein  31.23 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.833365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2763  hypothetical protein  30.55 
 
 
302 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0324358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>