24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3777 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3777  Pyoverdine biosynthesis protein  100 
 
 
274 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0236  hypothetical protein  41.79 
 
 
349 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0236  hypothetical protein  41.07 
 
 
349 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2987  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  42.55 
 
 
328 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35430  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  42.18 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000151483  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0229  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  42.91 
 
 
353 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0318  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  42.18 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0228  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  42.18 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1679  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  42.18 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.635621  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2754  pyoverdine biosynthesis  39.93 
 
 
322 aa  194  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0939  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.82 
 
 
352 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1225  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.82 
 
 
352 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2201  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.82 
 
 
352 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.929811  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1924  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.82 
 
 
352 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1103  Pyoverdine biosynthesis protein  37.91 
 
 
321 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3225  Pyoverdine biosynthesis protein  38.27 
 
 
321 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0703  pyoverdine biosynthesis protein  39.49 
 
 
295 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.215316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3133  Pyoverdine biosynthesis protein  37.32 
 
 
335 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02705  conserved hypothetical protein, putative pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein ditA (Eurofung)  34.12 
 
 
664 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.365279 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02606  pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02660)  30.74 
 
 
661 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.195968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3131  Pyoverdine biosynthesis protein  30.43 
 
 
587 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29841  predicted protein  29.39 
 
 
494 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0522184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1537  pvcA protein  25.39 
 
 
608 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1324  hypothetical protein  40.85 
 
 
853 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.995805  normal  0.179796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>