17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2823 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2823  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  612  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4673  hypothetical protein  73.4 
 
 
290 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7477  hypothetical protein  40.75 
 
 
305 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6046  hypothetical protein  40.07 
 
 
305 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5682  hypothetical protein  40.07 
 
 
305 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6532  hypothetical protein  40.07 
 
 
305 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  0.079973 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1698  hypothetical protein  41.32 
 
 
304 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2991  hypothetical protein  34.75 
 
 
343 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25392  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2701  hypothetical protein  34.43 
 
 
308 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3220  hypothetical protein  29.93 
 
 
350 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111198  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5528  hypothetical protein  48.84 
 
 
100 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3725  hypothetical protein  27.92 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3314  hypothetical protein  29.38 
 
 
260 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2527  Acetoacetate decarboxylase  32.52 
 
 
240 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11656  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6091  hypothetical protein  36.36 
 
 
84 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714568  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1252  hypothetical protein  32.76 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4103  hypothetical protein  27.7 
 
 
238 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.706455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>