19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1574 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1574  protein of unknown function DUF350  100 
 
 		 149 aa  288  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00727818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01250  protein of unknown function (DUF350)  54.55 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.993492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0116  protein of unknown function DUF350  56.72 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7052  hypothetical protein  40.58 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2364  hypothetical protein  40.15 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4693  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0865  hypothetical protein  38.1 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0702  protein of unknown function DUF350  38.21 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.406118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2235  hypothetical protein  37.17 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2756  protein of unknown function DUF350  28.91 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12619  integral membrane protein  36.36 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.951061  normal  0.527246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1155  protein of unknown function DUF350  33.08 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.735897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1863  hypothetical protein  35.51 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1883  hypothetical protein  36.36 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0848062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1929  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0681  protein of unknown function DUF350  30.3 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2138  protein of unknown function DUF350  34.85 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5175  protein of unknown function DUF350  27.82 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0124  hypothetical protein  35.35 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000227824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>