33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0822 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  55.7 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  57.69 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  57.69 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  57.69 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  56.41 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  47.62 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  53.75 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  55.13 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  53.93 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  54.55 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  50.62 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  55.13 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3626  thiamineS protein  48.39 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.014511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  44.44 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  48.86 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4729  MoaD family protein  35.44 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.75 
 
 		 217 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.5 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  42.68 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  45.68 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0225  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.11 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000241588  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  33.75 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1833  thiamineS protein  40.3 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.44 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  43.59 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  46.91 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  46.91 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  51.19 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3195  molybdopterin converting factor, subunit 1  28.57 
 
 		 238 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  31.82 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3329  MoaD family protein  29.87 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.33 
 
 		 83 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>