35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0815 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  100 
 
 
726 aa  1384    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  41.9 
 
 
751 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  41.98 
 
 
777 aa  446  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  42.55 
 
 
764 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  42.66 
 
 
739 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  42.41 
 
 
764 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  42.47 
 
 
748 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  42.11 
 
 
756 aa  428  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  41.37 
 
 
751 aa  412  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  43.7 
 
 
747 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  37.82 
 
 
758 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  39 
 
 
752 aa  334  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  36.62 
 
 
837 aa  333  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  37.42 
 
 
790 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  39.65 
 
 
876 aa  301  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  34.35 
 
 
789 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  40.41 
 
 
857 aa  281  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  34.21 
 
 
820 aa  276  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  35.31 
 
 
759 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  37.22 
 
 
789 aa  267  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  34.75 
 
 
758 aa  256  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  34.67 
 
 
820 aa  252  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  34.36 
 
 
761 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  39.52 
 
 
817 aa  221  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  34.36 
 
 
826 aa  216  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  33.84 
 
 
834 aa  211  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  37.8 
 
 
762 aa  205  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  38.22 
 
 
953 aa  191  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  39.2 
 
 
745 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  30.53 
 
 
822 aa  160  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  31.19 
 
 
779 aa  155  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  30.09 
 
 
798 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  30.61 
 
 
719 aa  128  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  30.21 
 
 
840 aa  117  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  33.91 
 
 
856 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0638496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>