11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0199 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0199  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2804  hypothetical protein  37.04 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28320  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0396  hypothetical protein  34.62 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0697  hypothetical protein  34.02 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.756425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5920  hypothetical protein  34.04 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1967  hypothetical protein  25.49 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000966023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1909  hypothetical protein  30.25 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409563  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4613  hypothetical protein  25.62 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0084  hypothetical protein  28.7 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4824  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>