16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0171 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0171  cutinase precursor  100 
 
 
313 aa  629  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0170  hypothetical protein  62.88 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13836  hypothetical protein  43.36 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.353538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1167  cutinase  44.14 
 
 
335 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5642  cutinase  45.02 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0212  hypothetical protein  46.44 
 
 
337 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5012  cutinase  42.8 
 
 
335 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5100  cutinase  42.8 
 
 
335 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.802756  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5393  cutinase  42.8 
 
 
335 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147295 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5535  hypothetical protein  32.54 
 
 
457 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.439091 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5937  hypothetical protein  32.54 
 
 
457 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252857  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0124  cutinase  30.25 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1763  hypothetical protein  30.1 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4874  hypothetical protein  27.27 
 
 
626 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1762  hypothetical protein  27.01 
 
 
623 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635017  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4311  Cutinase  31.09 
 
 
239 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>