39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1392 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  93.73 
 
 		 367 aa  709    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  92.92 
 
 		 367 aa  703    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  93.19 
 
 		 367 aa  707    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 		 367 aa  746    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  71.78 
 
 		 369 aa  550  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  56.28 
 
 		 379 aa  418  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  57.83 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.55 
 
 		 389 aa  360  3e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  42.42 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  40.22 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  40.22 
 
 		 367 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  40.22 
 
 		 367 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  34.54 
 
 		 430 aa  224  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  35.98 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  36.21 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  37.18 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  37.14 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  35.65 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  32.1 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  33.82 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  33.24 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  32.33 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  32.94 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.51 
 
 		 362 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  33.83 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  30.96 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  32.33 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  31.42 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  29.76 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  29.91 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  32.85 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  31.11 
 
 		 370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  31.23 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  29.21 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  28.82 
 
 		 559 aa  97.1  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  23.95 
 
 		 432 aa  93.2  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27014  predicted protein  30.26 
 
 		 287 aa  93.2  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0279403  normal  0.0136943 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  33.67 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31531  predicted protein  24.08 
 
 		 414 aa  49.7  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288827  normal  0.0593553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>