18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3112 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3112  Phenol hydroxylase conserved region  100 
 
 
119 aa  246  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0210  phenol hydroxylase region  63.03 
 
 
118 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3359  phenol hydroxylase region  60.5 
 
 
118 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3793  phenol hydroxylase region  55.93 
 
 
118 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000826781  hitchhiker  0.00225505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1327  phenol hydroxylase region  56.3 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2281  phenol hydrolase gammma subunit  56.78 
 
 
120 aa  144  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2792  phenol hydroxylase region  58.12 
 
 
118 aa  143  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3551  Phenol hydroxylase conserved region  58.41 
 
 
121 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4627  Phenol hydroxylase conserved region  58.41 
 
 
121 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5684  phenol hydroxylase region  55.17 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3305  phenol hydrolase gammma subunit  53.85 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2967  phenol hydroxylase region  53.85 
 
 
118 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1703  phenol hydroxylase region  49.17 
 
 
120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3307  phenol hydroxylase region  46.15 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1783  phenol hydroxylase region  46.67 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08820  Phenol hydroxylase subunit P4  47.86 
 
 
119 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30720  Multi-component phenol hydoxylase, gamma subunit; LapO  45.61 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0527  phenol hydroxylase subunit P4  27.52 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>