100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1201 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  100 
 
 
175 aa  345  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  45.34 
 
 
168 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  41.78 
 
 
172 aa  134  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  46.15 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  44.76 
 
 
174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  44.76 
 
 
174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  44.06 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  45.58 
 
 
171 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  45.77 
 
 
170 aa  124  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  44.52 
 
 
168 aa  124  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  46.15 
 
 
169 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  42.47 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  46.31 
 
 
167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  45.56 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  42.24 
 
 
183 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  40.99 
 
 
183 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  40.52 
 
 
176 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  40.52 
 
 
176 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  39.44 
 
 
163 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  40.88 
 
 
183 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  41.18 
 
 
176 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  40.67 
 
 
177 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  41.61 
 
 
183 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  39.07 
 
 
176 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  40.14 
 
 
168 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  39.22 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  39.22 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  39.22 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  39.22 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  39.22 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  39.22 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  39.22 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  38.78 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  38.78 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  37.89 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  39.07 
 
 
161 aa  94.4  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  42.76 
 
 
173 aa  94.4  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  34.97 
 
 
179 aa  92  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  35.97 
 
 
190 aa  91.3  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  36.73 
 
 
169 aa  84  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  28.57 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  32.21 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  30.41 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  28.93 
 
 
207 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  28.83 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  30.61 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  30.61 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  26.75 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  27.78 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  32.65 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  30.49 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  29.05 
 
 
201 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.06 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  26.42 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  34.93 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  30.06 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  32.03 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  31.01 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  30.2 
 
 
201 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  28.97 
 
 
187 aa  54.7  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  29.45 
 
 
164 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  27.52 
 
 
201 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  28.57 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  27.39 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  28.86 
 
 
201 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  24.85 
 
 
202 aa  52  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  27.27 
 
 
164 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  29.05 
 
 
191 aa  51.2  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  24.4 
 
 
220 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  26.09 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  25.68 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  31.25 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  26.23 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  25.47 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  25.47 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  25.47 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  26.53 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  25.47 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  24.84 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  24.84 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  24.84 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  24.84 
 
 
164 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  24.83 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.17 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  31.45 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  27.4 
 
 
208 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.1 
 
 
196 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.1 
 
 
196 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.1 
 
 
196 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.1 
 
 
196 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.1 
 
 
196 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.88 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  27.21 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  23.17 
 
 
193 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  23.17 
 
 
193 aa  41.2  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>