15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2867 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2867  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.438274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3432  hypothetical protein  53.78 
 
 
119 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275835  normal  0.581055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4187  hypothetical protein  52.1 
 
 
119 aa  120  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1176  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1390  hypothetical protein  50.85 
 
 
120 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2402  hypothetical protein  50.85 
 
 
122 aa  103  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1248  hypothetical protein  47.54 
 
 
125 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2178  hypothetical protein  51.79 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.207131  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1617  hypothetical protein  45.05 
 
 
127 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0691  hypothetical protein  56.67 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0427  hypothetical protein  46.22 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2361  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000168319  unclonable  0.000000122129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0940  hypothetical protein  44.76 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0739  hypothetical protein  42.98 
 
 
221 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355396  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0581  hypothetical protein  40.86 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>