76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2731 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  344  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  34.56 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  47.3 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  31.25 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  28.89 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  41.79 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  35.54 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  30.34 
 
 
147 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  33.54 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  28.33 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  31.78 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  32.33 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  30.08 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  31.33 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  23.61 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  27.27 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  29.22 
 
 
198 aa  52  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  31.11 
 
 
160 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  40.28 
 
 
146 aa  52  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  30.37 
 
 
160 aa  51.6  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  34.57 
 
 
210 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  29.1 
 
 
174 aa  50.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  26.39 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  29.89 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  33.07 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  29.71 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  20.81 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  34.83 
 
 
210 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  25.18 
 
 
163 aa  48.5  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  29.46 
 
 
160 aa  48.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  42.25 
 
 
149 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  40.85 
 
 
190 aa  48.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  40.85 
 
 
190 aa  48.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  47.8  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  47.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  21.37 
 
 
163 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  28 
 
 
175 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  30.52 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  39.44 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  30.33 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  25.34 
 
 
172 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  29.87 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  27.21 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
377 aa  45.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  27.21 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0342  hypothetical protein  30.84 
 
 
209 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0147738  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  29.41 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  27.94 
 
 
397 aa  44.7  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  27.27 
 
 
188 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  27.03 
 
 
163 aa  44.7  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  33.85 
 
 
234 aa  44.7  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  30.43 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  39.68 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  26.03 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  28.18 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  25 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  38.03 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  26.32 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  32.93 
 
 
218 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  29.03 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  33.65 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  29.41 
 
 
196 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
395 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  28.78 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  40.32 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  29.03 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  35.21 
 
 
178 aa  41.2  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  30.77 
 
 
197 aa  40.8  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  40.8  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>