12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1718 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1718  metallophosphoesterase  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0362853  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6150  metallophosphoesterase  45.71 
 
 
228 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0823  metallophosphoesterase  45.69 
 
 
236 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0086  hypothetical protein  40.51 
 
 
228 aa  165  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00135012  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3343  metallophosphoesterase  43.39 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1333  metallophosphoesterase  39.91 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1332  metallophosphoesterase  37.55 
 
 
287 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992901  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5905  hypothetical protein  45.37 
 
 
208 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2548  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0293  metallophosphoesterase  33.5 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2256  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  hitchhiker  0.0021497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0919  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0649979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>