20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1637 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1637  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0735  hypothetical protein  54.07 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3001  major head subunit protein  47.7 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0095  hypothetical protein  49.34 
 
 
299 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131989  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1304  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  45.87 
 
 
298 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171112  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2096  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  45.87 
 
 
298 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0675  prophage MuSo1, major head subunit, putative  43.52 
 
 
306 aa  275  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2144  prophage MuSo1, major head subunit, putative  42.19 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2098  prophage MuSo1, major head subunit, putative  41.86 
 
 
306 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.168211  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1607  Mu-like prophage major head subunit gpT  43.05 
 
 
298 aa  266  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4497  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  45.57 
 
 
298 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3356  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  41.39 
 
 
296 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1882  Mu-like prophage major head subunit  45.07 
 
 
293 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0682  major head subunit  38.38 
 
 
299 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0755  major head subunit  38.38 
 
 
299 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2685  prophage MuSo2, major head subunit, putative  36.75 
 
 
299 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2243  Mu-like prophage major head subunit gpT  38.16 
 
 
293 aa  205  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  50 
 
 
299 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0952  Mu-like protein prophage major head subunit gpT-like protein  28.47 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000512523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1974  Mu-like prophage major head subunit gpT  50 
 
 
61 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>