16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1284 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1284  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.825069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1911  hypothetical protein  41.05 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309436  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2116  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1881  type IV pilus assembly PilZ  38.3 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0072  type IV pilus assembly PilZ  38.64 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3578  type IV pilus assembly PilZ  37.89 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1681  type IV pilus assembly PilZ  37.89 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1705  type IV pilus assembly PilZ  37.23 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2164  type IV pilus assembly PilZ  37.23 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0370021  normal  0.992287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1111  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2169  type IV pilus assembly PilZ  29.17 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2358  hypothetical protein  36.14 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2244  hypothetical protein  29.79 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.934041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27930  hypothetical protein  34.88 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1618  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.837272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1928  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>