15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0432 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2900  phage uncharacterized protein  62.91 
 
 
556 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280001  normal  0.181567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4110  phage uncharacterized protein  63.48 
 
 
556 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0432  phage uncharacterized protein  100 
 
 
537 aa  1100    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0728  phage uncharacterized protein  62.67 
 
 
558 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0249  phage uncharacterized protein  39.96 
 
 
527 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4228  phage uncharacterized protein  39.15 
 
 
594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.76146  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0266  hypothetical protein  32.44 
 
 
500 aa  224  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2384  phage protein  28.6 
 
 
571 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3908  phage uncharacterized protein  31.47 
 
 
555 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5343  phage uncharacterized protein  28.72 
 
 
586 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3672  hypothetical protein  26.41 
 
 
505 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2131  hypothetical protein  26.54 
 
 
703 aa  89.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1847  hypothetical protein  31.41 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105061  normal  0.57122 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4168  hypothetical protein  28.3 
 
 
612 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0632962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  22.58 
 
 
488 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>