16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2513 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2513  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  912    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3763  hypothetical protein  37.89 
 
 
582 aa  242  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4066  hypothetical protein  35.11 
 
 
601 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1384  hypothetical protein  34.22 
 
 
471 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0753  hypothetical protein  31.09 
 
 
489 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0387662 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0461  hypothetical protein  30.86 
 
 
513 aa  104  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.274744  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1413  hypothetical protein  26.92 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0668579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1208  hypothetical protein  32.8 
 
 
528 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7607  hypothetical protein  31.06 
 
 
582 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1265  hypothetical protein  25.47 
 
 
558 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2547  hypothetical protein  35.12 
 
 
538 aa  57.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1194  hypothetical protein  28.68 
 
 
577 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20770  hypothetical protein  28.01 
 
 
560 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0250367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2345  hypothetical protein  27.47 
 
 
507 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.274272  hitchhiker  0.00000585461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09080  hypothetical protein  31.68 
 
 
574 aa  47  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.391282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0747  glycosyltransferases-like  27.45 
 
 
1713 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>