24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1455 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07750  hypothetical protein  58.65 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  57.03 
 
 
133 aa  138  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  43.2 
 
 
136 aa  84.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3823  Protein of unknown function DUF2267  38.89 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3772  Protein of unknown function DUF2267  39.02 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  39.68 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0721  hypothetical protein  42.06 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0171189  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  38.58 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  38.28 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  37.3 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3703  Protein of unknown function DUF2267  37.19 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  35.16 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  30.71 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  30.28 
 
 
142 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  25.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  28.91 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  29.13 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
286 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  30.97 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  29.37 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9245  hypothetical protein  32.54 
 
 
268 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  33.04 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>