38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0889 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  39.31 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  50.57 
 
 		 194 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  54.24 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  50.85 
 
 		 191 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  47.57 
 
 		 200 aa  165  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  43.62 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  47.54 
 
 		 366 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  50.29 
 
 		 198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  47.8 
 
 		 189 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  46.24 
 
 		 194 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  48.55 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  45.35 
 
 		 183 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  44.19 
 
 		 183 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  44.19 
 
 		 183 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  42.94 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2741  transport-associated protein  53.85 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.44364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1799  hypothetical protein  43.04 
 
 		 84 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  29.53 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  26.89 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  25.97 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  27.59 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  31.79 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16860  putative phospholipid-binding protein  43.21 
 
 		 94 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.817215  normal  0.322334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0572  transport-associated  40.51 
 
 		 84 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  25.77 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1220  hypothetical protein  28.24 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.17937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1090  hypothetical protein  32.63 
 
 		 171 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  26.09 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  27.08 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0491  hypothetical protein  28.66 
 
 		 182 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.754962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  29.25 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4055  hypothetical protein  24.64 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  29.25 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0980  hypothetical protein  30.36 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  25.34 
 
 		 223 aa  42.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3963  hypothetical protein  36.71 
 
 		 92 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166833  normal  0.240575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>