22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4063 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4063  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  290  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2638  hypothetical protein  38.24 
 
 
148 aa  87.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0787  hypothetical protein  35.2 
 
 
147 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2066  hypothetical protein  38.1 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.126661  normal  0.369814 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0486  hypothetical protein  27.69 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.609033  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4875  hypothetical protein  36.8 
 
 
349 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0512749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3618  hypothetical protein  26.19 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.852641  normal  0.135457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0789  hypothetical protein  25.62 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0740  hypothetical protein  25.62 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2348  hypothetical protein  29.33 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0269343  normal  0.0953844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3970  hypothetical protein  23.97 
 
 
140 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1143  hypothetical protein  24.53 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2205  hypothetical protein  26.55 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1520  hypothetical protein  27.73 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0591214  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2503  hypothetical protein  35.07 
 
 
350 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231485  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0429  hypothetical protein  25.41 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0510307  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2260  hypothetical protein  26.85 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4124  hypothetical protein  25.19 
 
 
152 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1331  hypothetical protein  23.68 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0828445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1577  hypothetical protein  23.08 
 
 
140 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401749  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1320  hypothetical protein  23.08 
 
 
140 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0990906  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3038  hypothetical protein  30.77 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>